本所第一層級設所長一人綜理所務，指揮監督本所員工。
第二層級下設三課一室分別為：農務研究課、農業推廣課、行政管理課及會計室分別掌理各有關事項。
第三層級編制員額；本所課長、技正、技士、技佐、課員、辦事員、會計主任等計職員12人，技工和工友25人，共計37員。
